La parroquia está ubicada cerca al núcleo urbano de la ciudad de Otavalo y colinda con la quebrada Ilumán al norte y el Río Jatun Yacu al sur. Posee zonas de vida correspondientes a bosque muy húmedo o páramo (correspondiente a la parte alta de la parroquia que comprende al volcán Imbabura), bosque húmedo montano y bosque seco montano bajo, con temperaturas que oscilan los 4o y 14oC, mientras que las precipitaciones varían de 900 a 1000 mm anuales.
Posee una extensión de 9.79km 2. Su ubicación es estratégica por encontrarse junto a la panamericana que conecta a los grandes polos de desarrollo de la zona norte, con la capital, si como con la frontera con Colombia.
La parroquia presenta un área consolidada que cubre la mitad del área de la cabecera parroquial que forma parte del área urbana, ubicándose barrio Atahualpa y en el centro de la comunidad de Quinchuquí. Existe el área en proceso de consolidación, que se encuentra en la parte alta y baja del área urbana cobijando barrios como Atahualpa, Central, FakchaLlakta, Imbaquí, Peguche Tío, Tahuantinsuyo, parte de la comunidad de Quinchuquí y Agato, junto a ellas están las áreas de expansión que destacan en gran parte del área considerada de Transición. Esto arroja una lectura de crecimiento horizontal longitudinal y transversal lo que deja zonas dentro de la misma área urbana sin mayor densidad edificada.
Comunidades de la Parroquia
En la parroquia de Dr. Miguel Egas Cabezas existe 7 comunidades indígenas y 6 barrios en el centro parroquial, de las cuales el centro parroquial Peguche es la más poblada con un número de 874 familias y la comunidad con menor población de familias es la comunidad de Fakcha Llakta con 68 familias